Akademia Piłkarska Mazur Ełk prowadzi szkolenie dzieci i młodzieży od najmłodszych roczników po zespoły młodzieżowe, a także sekcję dziewczęcą. Pracę szkoleniową koordynuje trener koordynator Akademii.
Trenerzy Akademii
Bartłomiej Koniecko
Trener koordynator Akademii · trener roczników 2010–2011 i 2012–2013
Kacper Koniecko
Asystent trenera · roczniki 2010–2011 i 2012–2013
Mateusz Filimonow
Trener · roczniki 2014–2015
Mateusz Wielgat
Trener · roczniki 2018–2021, trener drużyny rezerw MKS II Mazur Ełk
Patryk Gondek
Trener · roczniki 2018–2021
Kamil Suchocki
Trener sekcji dziewczęcej
